Ekskomunikacija yra bausmė tikintiesiems, esantiems kai kuriose religinėse konfesijose, pavyzdžiui, krikščionybėje, judaizme ir kt. Procedūra apima ekskomunikaciją iš bažnyčios apeigų arba pašalinimą iš Bažnyčios.
Ekskomunika (ekskomunikacija) gali būti sąlygiškai suskirstyta į dvi kategorijas: laikinas draudimas dalyvauti bažnyčios sakramentuose ir sutariamai paskelbta ekskomunikacija (anatema), kai asmuo neturi teisės dalyvauti sakramentuose, maldose ir atimamas bendravimas su tikintieji. Anatemą gali pašalinti tik atitinkamą valdžią turintis vyskupas. Tiek paprastiems tikintiesiems, tiek bažnyčios tarnautojams taikoma bažnyčios ekskomunikacija. Kiekviena konfesija turėjo savas ekskomunikacijos priežastis, tačiau tarp pagrindinių galima įvardyti netikrus nusikaltimus: vagystes, ištvirkavimą, svetimavimą, kyšio gavimą ar davimą paskyrus į bažnyčios raštinę, bažnyčios taisyklių pažeidimą ir kt. Asmenims buvo taikoma apatijos ir erezijos anatema. Jei apostazė yra visiškas paties žmogaus atsisakymas tikėjimo, tai erezija vadinama daliniu Bažnyčios dogmų atmetimu ar kitu jo religinio mokymo aiškinimu. Bet kokiu atveju tai visada buvo laikoma nuodėme. Rusijoje tikėjimo atsisakymas buvo prilygintas religijos kėsinimuisi ir buvo baudžiamas laisvės atėmimu (sunkiu darbu, kalėjimu ar tremtimi). Tėvynės išdavikai taip pat buvo anatematizuoti. Pavyzdžiui, Stepanas Razinas, Emelyanas Pugačiovas, etmonas Mazepa ir kiti. Kadangi pasaulietinė vyriausybė stojo ginti ne tik imperijos, bet ir pačios Bažnyčios, todėl bet koks nusikaltimas valstybei buvo prilyginamas antibažnyčios veiksmams, ir buvo nubaustas bažnyčios pasmerkimu, taikant anatematizaciją, stačiatikių bažnyčia nedalyvavo smurtinėje erezijos naikinimo srityje, tada Katalikų bažnyčia viduramžiais išgarsėjo dėl eretikų deginimo. Europoje tokios bausmės buvo skiriamos žmonėms, kurie abejojo religinės doktrinos teisingumu (Giordano Bruno atveju) arba buvo apkaltinti raganavimu. Verta paminėti, kad tais laikais bet kuris asmuo, anonimiškai pasmerkęs, galėjo pasirodyti Šventosios inkvizicijos teisme ir būti nuteistas mirties bausme pakariant ar sudeginant, tačiau bet kuris atgailaujantis nusidėjėlis visada turėjo teisę į absoliutumą ir galimybę grįžti į Bažnyčios krūtinę. Juk nusidėjėlis ekskomunikuojamas ne dėl pačios nuodėmės, o dėl nenoro atgailauti ir atsinaujinti.