Tikrosios Kubano potvynio, nusinešusio kelis šimtus gyvybių ir sugriovusių tūkstančius namų, priežastys nežinomos. Tačiau yra keletas šio balo teorijų, tiek oficialių, tiek „populiarių“.
Liepos 7-osios naktį Kubane prasidėjo potvynis, sugriovęs namus Gelendžike, Novorosijske, Krymske ir daugelyje kaimų. Tą akimirką, kai pasirodė pirmasis nepaprastųjų situacijų ministerijos įspėjimas, išgyvenusieji jau sėdėjo ant namų stogų, o pagyvenę žmonės, vaikai ir neįgalieji, kurie negalėjo pabėgti, buvo nužudyti. Būtent šis faktas leidžia tvirtinti, kad ekstremalių situacijų ministerijos atstovai iš dalies yra kalti dėl šimtų žmonių, kurie laiku neįspėjo apie nelaimę ir neorganizavo evakuacijos, mirties.
Teigiama, kad per daug kritulių yra viena iš potvynių priežasčių. Remiantis oficialiais pareiškimais, per dieną Kubaną užklupo penkių mėnesių krituliai, dėl kurių upės užliejo ir užliejo miestus. Ypač skaudžiai nukentėjo Krymskas, kur vandens lygis vietomis viršijo trijų metrų ribą. Upelis buvo toks stiprus, kad vandens slėgis apvertė lengvuosius automobilius ir net sunkvežimius.
Neoficiali versija, kurią pareigūnai atmeta, yra Neberdzhaevsky rezervuaro proveržis arba organizuotas ar automatinis vandens išleidimas iš jo. Visų pirma, Tyrimo komiteto atstovams pavyko nustatyti, kad prasidėjus stipriam lietui iš rezervuaro vanduo ištekėjo, tačiau tiksliai pasakyti, kas būtent tai paskatino tragediją, neįmanoma. Taip pat sklando gandai, kad kanalizacija nebuvo automatinė, o specialiai organizuota, nes pareigūnai turėjo pasirinkimą: užtvindyti Krymską ar leisti vandeniui prasiskverbti pro kitas Kubano dalis, įskaitant teritoriją, kurioje yra prezidento Putino dacha. Ši versija nebuvo nei patvirtinta, nei paneigta.
Ir pagaliau oficiali teorija sako, kad potvynis Kubane įvyko dėl potvynių linkusių zonų vystymosi. Kad tragedija nepasikartotų ateityje, „Gosprirodnadzor“, „Rosvodresurs“ir „Roshydromet“buvo nurodyta imtis visų būtinų priemonių. Nutarta kuo greičiau atkurti hidrologinius postus, užtikrinti geriausią Krymsko ir Novorosijsko meteorologijos stočių veikimą, taip pat imtis priemonių užkirsti kelią naujoms stichinėms nelaimėms.