Pirmasis Rusijos caras ne iš Rurikų šeimos Borisas Godunovas mirė eidamas 53 metus 1605 m. Balandžio 13 d. Jo mirtis apgaubta paslapčių, ir iki šiol istorikai ginčijasi, ar jo mirtis buvo natūrali, ar smurtinė.
Kronikos dokumentai rodo, kad mirties dieną Godunovas atrodė sveikas, valgė didelį apetitą ir užkopė į bokštą, iš kurio mėgo apžiūrėti Maskvą. Tada jis nusileido nuo jos, pasijuto blogai. Prie caro iškviestas gydytojas nieko negalėjo padaryti, caras kraujuoja iš ausų ir nosies, netrukus Godunovo nebeliko.
Kaip rašė vienas iš Anglijos ambasadoriaus Thomaso Smitho atstovų, tuo metu buvusio Rusijos autokrato teisme, caras jautė, be pykinimo ir skausmo skrandyje, dar prieš atvykstant gydytojui.
Staigi Boriso Godunovo mirtis, skrandžio skausmai suteikia pagrindo įtarti, kad caras buvo nunuodytas. Jo mirtis buvo naudinga visų pirma netikro Dmitrijaus I šalininkams, kurių kariuomenė tuo metu artėjo prie Maskvos.
Žmonėse taip pat sklandė gandas, kad pats caras buvo apsinuodijęs nevilties priepuoliu, kurį sukėlė jo nepopuliarumas tarp žmonių, badas šalyje ir lenkų okupacija.
Žinodamas Boriso temperamentą, charakterį, aukščiausios valdžios troškimą, dėl kurio jis buvo pasirengęs viskam (jis buvo apkaltintas Ivano Rūsčiojo apnuodijimu, Ivano IV sūnaus Carevičiaus Dmitrijaus nužudymu) ir kurį jis pasiekė, tapdamas de faktinis Rusijos valdovas, vadovaujamas Fedoro Ivanovičiaus, galite abejoti Godunovo savižudybės versija. Rusijos žmonės, jo nuomone apie carą, greičiausiai buvo abejingi autokratui. Lenkų pažanga visoje šalyje taip pat negalėjo išgąsdinti caro, nes Rusijos istorijoje buvo dar blogesnių laikų, prisiminkime, pavyzdžiui, mongolų-totorių invaziją į Rusiją.
Nereikia pamiršti, kad Godunovas pastaruoju metu dažnai sirgo, o jo mirtis galėjo būti ilgos autokrato ligos pasekmė.