Viešpats Jėzus Kristus perspėjo savo mokinius ir apaštalus, kad jie bus persekiojami pasaulyje. Šių įvykių jiems ilgai laukti nereikėjo - jau pirmojo amžiaus antroje pusėje Romos valdžia pradėjo aktyvią veiklą, skirtą krikščioniško tikėjimo šalininkų persekiojimui.
Krikščionys pradėjo patirti persekiojimą iškart po Kristaus žengimo į dangų. Šie įvykiai aprašyti Naujojo Testamento Šventajame Rašte. Pagrindiniai persekiotojai buvo pirmiausia žydai, o tik paskui romėnų valdžia.
Pirmasis Romos imperatorius, persekiojęs krikščionis, buvo Neronas. Jis buvo Romos deginimo iniciatorius, o kaltė teko Kristaus pasekėjams. Krikščionys buvo vadinami ne tik pagonių religijos atsimetusiaisiais, bet ir žalingais Romos visuomenės nariais, dėl kurių kilo siaubingos gaisro, sunaikinusio kelias dideles Romos teritorijas, pasekmės. Taigi krikščionys buvo vertinami kaip Romos imperijos valstybės ir religinės sistemos priešininkai.
Istoriškai krikščionys taip pat buvo priskirti kitoms „nuodėmėms“prieš visuomenę, pagonybę ir valdžią. Taigi, laikydamiesi Kristaus pamokymų, pagonys matė baisius kanibalus, kurie tariamai susirinko į olas norėdami išgerti kūdikių kraujo. Šio įsitikinimo šaknys slypi tame, kad krikščionys nuo pirmųjų amžių suprato Kristaus kūno ir kraujo sakramento poreikį. Taip pat krikščionims buvo priekaištaujama dėl įvairių sugadintų orgijų, nesuprantamų aukų, kurias jie atnešė savo Dievui.
Imperatoriaus Trajano vadovaujamo krikščionių persekiojimo metu (98–117 valdymo metai) atsiranda nauja persekiojimo priežastis. Vienas baisiausių ir nepaaiškinamų. Vadinamasis nomen ipsum persekiojimas, kuris išvertus iš lotynų kalbos reiškia - „tik vardui“. Pakako pasivadinti krikščioniu, kad būtų įvykdytas mirties bausmė. Imperatoriaus valdžioje buvo tam tikri kūnai, kurie ieškojo krikščionių vėlesniems kankinimams.
Viena iš pagrindinių persekiojimų priežasčių yra krikščionių atsisakymas aukoti pagonių dievams. Už šį „žiaurumą“turėjo teisę įvykdyti bet kuris Romos imperatorius-persekiotojas. Būtent dėl to daugelis iškilių pirmųjų amžių bažnyčios vadovų kentėjo net iki mirties.
Krikščionių persekiojimas Romos imperijoje tęsėsi bangomis, kol imperatoriaus Konstantino Didžiojo laikais krikščionybė tapo valstybine religija (Milano ediktas 313 m. Buvo pagrindinis žingsnis vėlesnio krikščionybės kaip valstybinės Romos religijos formavimo link). Tačiau reikia pažymėti, kad net po Konstantino pasirodė imperatoriai, kurie galėjo persekioti krikščionis už atsisakymą grįžti prie pagonių religijos.
